TAFFISH

专注科学问题,

TAFFISH 助力研究！

安装
Install

什么是 TAFFISH？


        TAFFISH 让你无需操心软件安装，环境冲突、容器管理、集群操作……像执行普通 Shell 命令一样，构建、使用和分享属于你的可移植可复现的科学工作流。

        我们利用容器化技术（Docker/Podman/Apptainer）实现了高度的安装，环境与跨设备保障；使用 Common Lisp 实现了高度的自动，灵活与可拓展性；选择 Shell 作为目标语言实现了高度的普适与兼容性。

        我们的愿景：你们探索科学奥秘，我们搞定技术难题！合作搭建生物信息学的高速公路！


TAFFISH 全称：Tools And Flows Framework Intensify SHell

怎么使用 TAFFISH？


TAFFISH 的使用很简单，只需要遵循以下几个步骤即可：


  • 安装 Docker/Apptainer/Podman（推荐个人 Mac/Windows 用户使用 Docker，Linux 等多用户设备安装 Apptainer/Podman）；
  • 使用上述“安装”中的 shell 命令安装 taffish & taf；
  • 个人用户可能需要配置环境变量（详见 DOCS 安装相关信息）；
  • 运行 “taf update” 更新安装列表；
  • 运行 “taf install xxx” 安装你想使用的 xxx 这一 taf-app；
  • 运行 “taf-xxx …” 即可使用 xxx 这一 taf-app 了，例如用 “taf-xxx -h” 就可以查看 taf-xxx 这一 taf-app 的帮助信息。

授人以鱼不如授人以渔

——《淮南子·说林训》

LinDing Group - Center for Informational Biology - UESTC 

support@taffish.com

皖ICP备2023024706号-2

LinDing Group - Center for Informational Biology - UESTC 

support@taffish.com

皖ICP备2023024706号-2